所谓“两票制”，就是药品从药厂卖到一级经销商开一次发票，经销商卖到医院再开一次发票。
近年来，国家在医药行业实施了“两票制”改革。所谓“两票制”，就是药品从药厂卖到一级经销商开一次发票，经销商卖到医院再开一次发票。国家实施“两票制”，不仅可以优化药品购销秩序，提高药品流通效率，减少商品流通过程中的利益分配环节，防止药品价格虚高，而且使药品来源可追溯，防止假冒药品流入医院，保证用药安全。同时，“两票制”实施后，进一步压缩了企业虚开增值税发票的空间，对企业的税务合规提出了更高的要求。但一些药企仍然冒险虚开，由此带来的风险值得关注。
虚构公司虚开发票
2021年9月，某拟上市药企A公司在其《首次公开发行股票招股说明书》中，披露了该公司因取得虚开增值税普通发票被要求补缴相关税款、滞纳金的情况。该公司委托沈某负责X区域的产品市场策划及业务推广活动。由于药企原则上不与个人推广商开展业务合作，沈某便以S公司名义，与药企A公司签订了《市场推广服务协议》。S公司完成推广服务并经过验收后，药企A公司便向S公司支付了服务费用，并取得了由S公司向其开具的服务费增值税普通发票。
根据企业所得税法第八条规定，企业实际发生的与取得收入有关的、合理的支出，包括成本、费用、税金、损失和其他支出，准予在计算应纳税所得额时扣除。因此，药企营销成本税前列支首先必须满足实际发生，与取得收入有关且合理这三个实体性要件。成本的实际发生，应当由企业承担证明责任。同时，根据《国家税务总局关于发布〈企业所得税税前扣除凭证管理办法〉的公告》（国家税务总局公告2018年第28号）相关规定，药企必须满足取得增值税发票作为税前扣除凭证这一形式要件。
经查，S公司为虚假注册企业，且在纳税申报后直接走逃，遂认定A公司为取得虚开增值税普通发票，A公司补缴了相关税款和滞纳金。因为A公司存在实际发生的市场推广服务成本，未被定性为偷税行为。
虚开农产品收购发票
我国出于保护、支持“三农”发展的目的，允许农产品的购买者向农业生产者个人开具收购发票，并计算抵扣或核定抵扣增值税进项税额。基于该制度，即便上游企业的销项税额为零，下游企业仍然可以抵扣进项税额。一些不法分子利用这一点，打上了农产品收购发票的主意。
2023年12月，国家药监局披露了某制药企业B公司虚开发票的案件。该公司主营中药材和中药饮片的生产销售。经查，该药企虚开农产品收购发票5800余万元，并对外虚开了4200余万元的增值税发票，严重违法违规。
根据《国家税务总局关于纳税人虚开增值税专用发票征补税款问题的公告》（国家税务总局公告2012年第33号）规定，B公司对外虚开的4200余万元增值税发票的销项税额不得冲回。由于5800余万元农产品收购发票是虚开的，不得抵扣进项税额，因此企业需要补缴增值税。企业还须补缴城市维护建设税、教育费附加、地方教育附加。同时，根据企业所得税法规定，虚假收入和虚假成本均应冲回，并被加收滞纳金和罚款。B公司虚开发票和逃税的行为，还将被依法追究刑事责任。
建议高度重视风险控制
药企发票的取得和开具是否合法合规，一直是税务部门监管的重点。笔者提醒，广大药企应强化依法纳税的意识，加强对企业员工的业务培训和政策宣传，通过建立有效的发票管控制度，明确发票管理的各个环节和责任人，强化财务支付控制，坚决防范一些业务人员套取企业资金进行违法利益输送的行为。
同时，药企应当选择与纳税信用等级较高、纳税义务履行良好的服务供应商签订协议，避免交易对方出现虚假注册、不申报、不纳税、走逃失联等使本企业利益受损的情形。还要注意的是，企业须留存好相关资料备查。例如，与对方签署的书面服务合同，银行转账的付款记录以及服务发生过程中产生的业务单据、会议记录、市场走访明细台账、服务成果总结报告等。
