当前，“留存资料备查”已经覆盖了多种涉税业务，企业留存的所有与交易有关的资料，是证明企业合规的“护身符”。面对税务机关的核查或纳税检查，企业若无法提供符合规定的备查资料，也无法按规定补充资料，企业将面临补缴税款、加收滞纳金，甚至罚款的后果。

　　要求企业留存备查的资料，税务局真的会查吗？如果认真梳理、研究税务机关近年来公布的涉税案例，可以发现留存的所有与交易有关的资料，是证明企业合规的“护身符”，非常重要。面对税务机关的核查或纳税检查，企业若无法提供符合规定的备查资料，也无法按规定补充资料，企业将面临补缴税款、加收滞纳金，甚至罚款的后果。围绕备查资料的话题，记者近日采访了兰州财经大学财政与税务学院院长李永海?，国家税务总局慈溪市税务局党委委员、副局长何杰，德勤中国税企协商服务主管合伙人汤卫东。

　　企业“自证清白”的关键资料

　　记者：现行的税收政策规定中，留存资料备查的要求较为常见。您可否具体介绍一下，常见的相关政策规定有哪些？为什么要求企业留存备查资料？

　　何杰：从日常征管来看，留存资料备查已经覆盖了多种涉税业务。企业留存交易有关的有效资料，是企业合规经营的重要保障。不同税种、不同业务所对应的资料留存范围，政策上都有不同规定。其中，在企业所得税方面，企业需要留存资料备查的事项，主要涵盖申报收入、资产损失及其他扣除项目，享受企业所得税优惠政策及选择不征税收入处理等。

　　同时，在财产行为税领域，纳税人在享受保障性租赁住房房产税优惠政策时，需要将不动产权属、房屋租赁合同、保障性租赁住房项目认定书等相关资料留存备查；出口企业需严格留存备案单证及备查资料，主要涉及出口企业的购销合同、出口货物的运输单据、出口企业委托其他单位报关的单据；除了常见的税费政策要求留存的资料外，企业财务报表等也是重要的备查资料。

　　李永海?：的确，留存资料备查覆盖了几乎所有主要税种。要求企业留存备查资料，一方面能够进一步简化办税流程、精简涉税资料，优化税收营商环境；另一方面对纳税人的税务合规管理和税收遵从意识提出了更高的要求。比如，在增值税方面，需要企业留存的备查资料，主要体现在即征即退、统借统还、招用重点群体就业等情形。以X公司为例，企业安置残疾人就业，可适用增值税即征即退政策，须留存残疾人证复印件、社保缴纳凭证、工资支付清单等资料。

　　同时，在个人所得税方面，单位作为代扣代缴义务人，须留存全员全额扣缴申报明细、工资表、奖金发放表、劳务费支付记录，以及与员工签订的劳动合同等资料。作为扣缴单位，企业有义务告知员工自行保存专项附加扣除的备查资料，如子女教育、住房租金、住房贷款利息、赡养老人等证明文件。此外，纳税人申报享受城镇土地使用税、房产税、耕地占用税、车船税、印花税、城市维护建设税、教育费附加等税费优惠的，也需按照有关规定留存资料备查。

　　汤卫东：留存资料备查是税收征管中一种常见做法，备查资料可按照税收优惠事项、其他涉税事项等进行分类。对于税收优惠事项，纳税人需按照政策规定留存证明其符合优惠政策适用条件的各类资料。在其他涉税事项管理中，留存资料备查也得到了广泛应用。比如，企业在主张资产损失的企业所得税税前扣除时，需要根据规定留存证明资产损失真实性、合法性的有关资料。留存资料备查还涵盖了企业日常经营活动中涉税凭证的管理，包括账簿、发票、完税凭证等。比如，Y公司在开具农产品收购发票时，需妥善保管过磅单、入库单、收付款凭证、身份证复印件等原始凭证，以备后续核查。

　　留存备查不等于不查

　　记者：企业在办理涉税事项后，留存的资料是否一定会被核查？

　　何杰：留存备查不等于不查，现阶段不查也不代表永远不查。留存资料能够证明企业业务真实性和合规性，税务机关会通过后续管理，对纳税人进行定期或不定期检查，这是税收事中事后监管的核心环节。按照现行税收征管相关规定，税务机关应对相关事项适时开展后续管理。比如，根据相关文件要求，税务机关应加强研发费用加计扣除优惠政策的后续管理，定期开展核查，年度核查面不得低于20%。再如，近年来税务机关依托金税工程、大数据监管体系，对出口退税业务实行全流程风险监管，核查方式涵盖日常退税审核疑点排查、跨部门数据比对等形式，备案单证是税务机关验证出口业务真实性、判断退税合规性的核心依据。

　　李永海?：从《企业所得税优惠政策事项办理办法》（国家税务总局公告2018年第23号）等政策规定可以看到，企业办理税收事项或享受优惠事项后，税务机关将适时开展后续管理，核查企业留存的备查资料。要求企业留存资料备查，本质上是税务机关为了构建一种“宽进严管”的税收治理模式。这种制度设计体现了税法对纳税人的信任，简化了事前审批流程、降低了制度性交易成本，但并未弱化事中和事后监管。作为纳税人，一定要对自己的交易合规性负责，还需要承担举证责任。如近期某集团因特殊性税务处理适用问题补缴企业所得税及滞纳金的案例，正是税务机关在核查划转合同、批准文件、会计处理资料、锁定期内经营活动未变更说明等留存资料时，发现了企业的税务问题。可以说，备查资料是企业在事后核查中证明自身税务合规的“护身符”。

　　汤卫东：正如两位专家所说，税务核查工作一般以留存备查资料的真实性、完整性和逻辑一致性为核心，验证企业是否在实质上符合相关政策适用条件。企业所得税汇算清缴期结束后通常是风险分析与案头审核的集中期，但依托税务大数据动态监控，税务核查亦可在全年常态化启动。

　　比如，内地居民企业B公司向香港母公司C公司分配股息时，主张C公司为“受益所有人”，按照5%的优惠税率代扣代缴预提所得税，并留存其香港税收居民身份证明、持股证明及董事会决议等基础资料。后续管理中，税务机关核查发现，C公司虽提供了办公租赁合同、少量人员名单及部分投资记录，但从其备查资料来看，企业仅配备2名专职人员，无完整薪酬凭证及公积金缴纳记录，且其投资活动高度依赖第三方执行，缺乏独立决策流程、风控机制及核心人员履职记录，也未留存股息资金使用计划、董事会决议或再投资安排。税务机关综合判断认为，C公司留存的备查资料不足以证明其符合“受益所有人”的认定条件，故否定了其作为“受益所有人”享受税收协定待遇的资格，责令有关企业补缴税款及滞纳金。

　　未留存资料可能面临严重后果

　　记者：从税务机关公开披露的典型案例看，企业未合规留存备查资料会面临哪些后果？

　　何杰：税务机关如果在后续核查中，发现企业未能按照政策要求提供留存备查资料，或者提供的留存备查资料与实际生产经营情况、财务核算情况、相关技术领域、产业、目录、资格证书等不符，以及存在弄虚作假情况的，将依法追缴相关税款，并按照税收征管法等相关规定处理。最直接的影响结果就是不予办理涉税业务或追回已退税款。比如，我局在某外贸企业首次申报实地核查中发现，因为企业财务人员对出口业务税收政策不熟悉，相关运输单据缺失，企业存在未按规定留存备案单证的问题，最终导致该笔业务不予退（免）税。

　　李永海?：对企业来说，留存资料宁可备而未查，不能查时无备。从实务案例来看，企业未合规留存备查资料，很可能会面临补缴税款、加收滞纳金以及行政处罚的法律后果。如某光学仪器制造企业申报研发费用加计扣除1806万元，但在税务核查时无法提供立项文件、辅助账和工时记录等资料。最终，企业被税务机关判定违规申报研发费用加计扣除，面临补缴税款、缴纳滞纳金和罚款的风险。

　　“反向开票”是近年来税收征管中的一个特殊领域，对备查资料的要求更为严格。如某资源回收企业，2024年向多位自然人收购废金属，累计反向开具的增值税专用发票金额达500余万元。2025年，税务机关在后续管理时发现，该公司收购台账记录不全，缺少部分出售者的身份信息，也未留存相应的付款凭证和运输记录，无法证实业务的真实性。最终，税务机关认定该企业不得适用“反向开票”政策，其已开具的发票需作废或红冲，企业需依法补缴税款及滞纳金。

　　汤卫东：留存备查资料的缺失，会引发税务机关对有关交易实质或优惠适用性的质疑。企业若存在主观故意，可能构成偷税被处以罚款，情节严重的还可能被追究刑事责任。同时，企业纳税信用等级也可能受到影响，从而导致企业发票领用、出口退税、融资授信、招投标及政府采购等多方面受限，陷入“一处失信、处处受限”的经营困境。在实践中，某些享受优惠政策的企业虽已按照税法要求留存备查资料，但因处于“自行判别、申报享受”的初期阶段，不涉及税务机关的实质性审核，加之税务机关核查并无固定期限，这些企业便放松了对备查资料的重视。

　　将留存备查资料当作重要日常工作

　　记者：既然留存备查资料如此重要，企业应该怎么做好这项工作呢？

　　何杰：企业应当确保资料的真实、合法、有效，不得伪造、变造或者擅自损毁。同时，企业还需要注意不同涉税事项有明确的时间节点要求，做到即时收集、按期归档。比如，出口企业需在申报出口退（免）税后15日内，将备案单证留存备查。建议企业建立覆盖全税种、全涉税事项的留存备查资料管理制度，厘清财务、业务、采购、研发、人力等相关职能部门的协同责任，并做好人员离职交接工作，避免岗位变动、人员流失导致资料遗失。

　　李永海?：留存备查资料不是“一次性作业”，而是贯穿企业业务全过程的常态化管理事项，应当作为重要日常工作常抓不懈。建议纳税人在业务发生时同步留存相关资料，如研发项目立项时就留存立项文件，发生费用时就登记辅助账，存货报废时就在报废当日拍照留存，并取得第三方鉴定意见。同时，建议纳税人关注税务总局定期更新发布的《减免税政策代码目录》，在享受税收优惠前，先在目录中确认政策的适用条件和有效性，再按照要求留存备查资料。纳税人还应注意备查资料的保管期限，如涉税账簿、凭证及相关资料一般应保存10年；出口业务增值税退（免）税相关备案单证，不得擅自损毁，保存期为10年；个人所得税相关扣除和优惠信息资料，须自个人所得税汇算清缴期结束之日起留存5年。

　　汤卫东：备查资料形式齐备，并不等于实质合规，备查资料之间应当能够交叉印证业务的真实性。企业必须打破部门壁垒，构建一体化的备查资料管理链条。以企业开展研发项目为例，业务、研发等部门需在研发实施、合同签订、资产处置等环节同步生成并保存原始记录，而财税部门则需依据税收政策口径，对业务证据资料进行归集、核算、审核，并最终形成系统化的备查档案。对于留存资料中的数据收集、校验、传输或整理工作，企业可以积极考虑通过数字化手段完成，确保业务数据自动、准确、完整地同步更新至财务和税务管理系统。